一、按照我国土地法规定，农村的土地，除法律规定属国家所有的外，属农民集体所有，包括宅基地。农民集体所有的土地，一般由村级集体组织管理，按土地承包法，个人可以拥有使用权。一户农民只能拥有一处宅基地的使用权。
二、按相关规定，农民的房屋如需在原宅基地上重新修建，需要报当地规划部门批准。农民如出售或出租宅基地上的房屋，不再另给宅基地。
三、按土地法规定，宅基地的面积，有控制性标准，这个标准，由省级政府制订。但据我了解，由于历史沿革的原因，农民原有宅基地占有面积大，在一些村，平均达２亩的都有。一处农家院，周边还有竹林、树木、小水塘、晒坝等，这得承认历史。如属新增农户建房，才能按标准用地，这个占地标准大体在１００平方米左右
四、土地法同时又规定，各级政府包括乡级政府在内，都要编制土地利用规划。农村的土地，除兴办乡镇企业、村民住宅、乡（镇）村公共设施、公益事业建设等用地外，用于其他建设用途的，必须经过征用，变更为国有土地后，方能实施建设。这其中，就包括了宅基地。
五、依据上述几条，对宅基地和农村其他土地的征用，是一类问题。征用时，会用土地补偿费、安置补助费以及地上附着物和青苗的补偿费等方式，对农民进行补偿。其中征收耕地的土地补偿费，一般为该耕地被征收前三年平均年产值的六至十倍。地面房屋，依据情况补偿。
现在，我不知道你说的宅基地非法使用，属于那一种情况，所以如何纠正的问题就无从谈起。
现在容易出问题的是：
一是依法征收的土地，按国家标准补偿，农民依然会觉得低，不满意；二是甲地和乙地的补偿费差异导致的不满；三是补偿费被乡村或某些方面截留了（按规定，补偿方案应予公布，但有的地方不公布）等等。
这里有两个环节应注意：第一、农村的某一块土地一旦经批准划为征用地，既为征，即已具有强制性，不由你同意不同意；第二、补偿标准是法律确定了的，除个别特殊情况可再调高些外，嫌低也高不上去。所以，土地征用中的问题，常常还不是执法的问题，而是法本身的合理性问题。这个法的基础又在于农村的土地是集体的。如果是私有的，法的制订就会有很大变动。
现在不少学者都在讨论，农村的土地要不要私有化。这里面又牵涉到很复杂的问题，例如，如要私有，以什么为基础私有，是土改时的，还是承包时的。土改时的农民土地，是在政治制度变革时，由国家分配的，然后收归集体所有，再在改革中由农民向集体承包的。现在农民使用的土地，不是通过买卖交换而形成的具有所有权的土地，如要将土地的所有权分给农民，依据什么来分？依据什么来确权？农村的人口情况，现在已经有很大变动，怎么适应这种变动的情况？同时，附着在土地上的还有不少政策，如粮地，还涉及到多项种粮补贴问题等等，如何处理各类土地的关系？此外，还有若干问题，实在不是在这里简单说说，就能说得清楚的。
见你在补充说明中又补充了一户多宅的问题，如果是历史遗留下来的，处理起来可能也会很困难，有不少人家早已进城入户了，叫空壳户，按承包法土地应由集体收回，出于维稳，出于农村是熟人社会等因素，如果不是十分必要，也不会有谁愿意去惹这个麻烦的。当然也有些会在承包地或宅基地上多建房，甚至用于出租，住在里面的什么样的人都有，这种行为，现在叫住种房，已经不仅仅是宅基地的问题，已经导致了不少问题发生，不少地方在清理，应该说叫依法清理，冲突就发生了。
